IPC (Isotopic Pattern Calculator) is a tool for mass spectrometry that calculates the isotopic distribution of a given chemical formula or peptide sequence. It uses gnuplot to visualize the results.
Related ProjectsSamurai Graph, MPC-BE, CosmoDB, Freeverb3VST, gpx2shp |
labTimer is a set of timer suited to black and
white film processing. At the moment, the program
can follow a basic sequence of development,
fixing, and washing, with nice countdowns and
reminders.
Related ProjectsTERASOLUNA Framework, gpx2shp, Dumpper v.60.3, MPC-BE, Slackware Add-on package Project |
Hybridized Orbital Preview (HOPV) is an OpenGL
based application that traces selected wave
functions and plots electron clouds in 3D space.
Rendered models can be rotated and zoomed.
Related ProjectsDarik's Boot and Nuke, iReport-Designer for JasperReports, SmillaEnlarger, DeSmuME, Freeverb3VST |
Corplot aims at processing open corrosion
potential (OCP) and potentiodynamic scan (PDS)
corrosion experiments. Use it to plot Tafel plots
and fit the branches to determine the corrosion
current.
Related ProjectsDeSmuME, iReport-Designer for JasperReports, Freeverb3VST, JYUGEM, Darik's Boot and Nuke |
Kemistry is a collection of chemistry applications
written for the K Desktop Environment. Most of the
applications are simply ports to KDE of existing
X11 applications.
Related ProjectsMeCab, JYUGEM, gpx2shp, MPC-BE, Molby - A Molecular Modeling Software |
This is MolDS ("Mol"ecular "D"ynamics simulation package with "S"emiempirical quantum chemistry) project! Version 0 is under construction. So, although an official tarball have not been released yet, you can download source code from subversion repository:
Ver. 0.4(Under development): http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/trunk
Ver. 0.3.1: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.3.1
Ver. 0.3: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.3.0
Ver. 0.2: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.2.0
Ver. 0.1: http://svn.sourceforge.jp/svnroot/molds/tags/0.1.0
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Register Date: 2011-09-23 01:31
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Jude is a rapid application development tool to develop data management workgroup applications that easy-to-maintain for developers and easy-to-use for end users. It is based on a knowledge base with an object oriented structure on the server side and a compound document agent-based user interface on the client side.
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第三の生命鎖である「糖鎖」の質量スペクトルを解析するソフトウェアを開発するプロジェクトです。MALDI-TOF MSやESI-MSなどの質量分析器のデータからタンパク質の分子構造を同定するMS-fitやMascotの様なソフトウェアの技術を応用し開発しています。本プロジェクトにより、バイオインフォマティクス分野において、糖鎖関連の研究が活発化することを期待しています。
本プロジェクトのソフトウェアは下記のサイトに公開しています。 http://www.gsltools.sk.ritsumei.ac.jp/jpn.htm
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Register Date: 2009-10-25 12:24
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Conograph GUI (Windows/Mac) is distributed at (4/30/2013--):
https://z-code.kek.jp/zrg/ (webpage of KEK)
http://conograph.osdn.jp/ConographGUI/web_page_JP.html (webpage of the author)
Conograph core program (src only), BLDConograph (a standalone program for error-stable Bravais lattice determination, src/exe) and Peak search program (src/exe) are uploaded here. Conograph is based on the method introduced in Acta Cryst., A69, 603--610 (2013). The algorithm and results of Conograph are introduced in Acta Cryst., A69, 603--610 (2013) and J. Appl. Cryst. 47, 593--598 (2014). The algorithm of BLDConograph which is also used in Conograph is based on the method in Acta Cryst. A68, 525--535 (2012).
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Register Date: 2012-08-05 15:29
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ccwatcher は、実行時に計算化学計算の進行状況を監視します。GUI、「コマンド ライン インターフェイス」それ重要な出力をパースしている SCF エネルギーをプロットしていますいます。アボガドロ プラグイン機能が計画されています。
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- 可視化、実験とシミュレーションの核磁気共鳴 （NMR） スペクトルの処理のための無料のソフトウェア ツールです。
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BioNLP コーパスは biomedically と言語的コーパスと医用データ ソースのリポジトリです。このプロジェクト内の別々 のパッケージで利用できる多くのリソースがあります。
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トウヒチョウは聞き手は力分野の atom ベースとギブス アンサンブル分子構造サンプリングに対処するアルゴリズムに特に注意して使用流体相平衡推算の設計された分子のモンテカルロ ・ シミュレーション コードです。
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選択的並行編集を促進するために蛋白質 crystallographers のグラフィック ユーザー インターフェイスでユーザー フレンドリーな PDB (Protein Data Bank) ファイル エディター/データ抽出/自分の PDB ファイルの解析
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反復処理からベ格子探索アルゴリズムの実装である： ・ アンドリュースとバーンスタイン、Acta の水晶。(1988). A44、1009年 1018年格子と 6 空間内の点とベ格子の選択として減らされた細胞突起によって型します。
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