[MUSASHI-users 477] Re: AGM 実行結果に対する疑問点について

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shink****@pb3***** shink****@pb3*****
2005年 1月 26日 (水) 13:11:55 JST


Handaです。
鷲尾先生、早速ご返答いただきまして、ありがとうございました。


>>>疑問点1:サンプルデータの結果について
>>  agmを実行した結果がグラフ頂点IDのリストになっていますが、
>>  この結果は、説明にあるように、
>>  『発ガン性を引き起こす部分分子構造が含まれている可能性が高い』
>>  構造なのでしょうか?
>>  それとも、あくまでもサンプルなのでしょうか?
>
>サンプルデータは、GMLを示すためのあくまでサンプルです。
>発がん性とは関係ありません。


私の書き方が不明瞭で、申し訳ありませんでした。
疑問点2とも関係するのですが、
サンプルデータの結果は、
agmの解析結果として想定している結果なのか、
どうかということをお伺いしたかったのです。

サンプルデータの結果をみますと、
 ======
    <Graph graphId="2" miningStatus="induced" support="1.000">
      <Vertex vertexId="1" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="1"/>
      </Vertex>
    </Graph>
    <Graph graphId="3" miningStatus="induced" support="1.000">
      <Vertex vertexId="1" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="2"/>
      </Vertex>
    </Graph>
  ======
このような結果があります。

この結果は、
"1" というグラフと
"2" というグラフだと思われますが、
私が想定していた化合物解析におけるagmの結果は、
"C:C-O"のような原子のグラフであって、
"1:2-3"のような頂点IDのグラフではありませんでした。

ということで、
サンプルデータがまったくのサンプルなのか、
そうでないのかをお伺いしたかったわけです。


そして上記の結果が、まったくのサンプルで無かった場合、
疑問点2として、頂点IDのグラフではなく、
原子のグラフを結果として出力することは出来るのか、
お伺いしたかったわけです。


疑問点3に関しては、よく理解できました。
連結がない(もしくは重みが0)グラフだと認識していました。


丁寧なご説明ありがとうございました。
もう一度、理解に努めようと思います。


=====
Handa
shink****@pb3*****







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