シューアは対話的にリー群と対称関数のプロパティを計算するためのスタンドアロン プログラムです。シューアの化学者、数学者、コンピューター科学者に興味の問題の広い範囲に関連性の高い質問に答えるように設計されています.
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Fitykは、非線形の曲線あてはめ(カーブフィッティング)およびデータ解析ソフトウェアです。特に実験データの曲線あてはめ(ガウス関数のような釣鐘型関数、ローレンツ関数、ピアソンVII関数、フォークト関数)に特化しています。
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化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール (経口毒性) - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。
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アセンドは、モデリング環境と大規模または小規模システムの非線形方程式、工学、熱力学、化学、物理学、数学、生物学の使用のためのソルバーです。定常および動的 (NLA & DAE) 問題については、ソルバは資
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Jmol/JSmol は、3次元の分子化学構造のためのビュワーで、次のそれぞれ4つのモードで働きます。jQuery を用いる HTML5-only のウェブアプリケーションとして、Java applet として、スタンドアローンの Java プログラム (Jmol.jar) として、そして、"headless" なサーバーサイドのコンポーネント (JmolData.jar)として。 Jmol は次に示すような複数のファイルタイプに対応しています。PDB, CIF, SDF, MOL 形式の他、PyMOL PSE や Spartan のファイル、そして、Gaussian, GAMESS, MOPAC, VASP, CRYSTAL, CASTEP, QuantumEspresso, VMD, およびその他の量子化学計算プログラムからの出力など。 いくつかのデータベース( RCSB, EDS, NCI, PubChem, MaterialsProject )からは、直接ファイルを読み込むことができます。また、複数のファイルを読み込んで、同時に比較することができます。 豊富な記述言語とよく作りこまれた web API によって、ユーザのインターフェイスを簡単に最適化することができます。 インタラクティブなアニメーションと線形のモーフィングなどが可能です。Jmol のインターフェイスは、次のような目的に適しています。分光法における JSpecView、JSME における 2D → 3D 変換、POV-Ray の画像、そして CAD プログラムの 3D プリンティング (VRML export)。
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!OpenChrom はガス ・ クロマトグラフィーおよび質量分析のためのツールです。フォーカスが別の GC/MS システムやベンダーからデータ ファイルを処理します。その機能とアルゴリズムは、Eclipse RCP に基づく柔軟なプラグインのアプローチを使用して拡張できます。
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メスマー (マルチ エネルギーよく反応マスター方程式ソルバ) 衝突エネルギー移動と解離、異性化、協会、および非断熱ホッピング プロセスの化学反応の相互作用をモデル化します。
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!OpenChem ワークベンチは作成、保存、検索、および化学データを交換するために設計された、エンタープライズ ソフトウェア スイートです。NIST、ガウス (CHEMKIN) 既存のツールを使用して、その自身 (簡単な分子建物の機構の管理、グループの加成性などです)。
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足場のハンターは構造に関する生化学的データ分析のための JAVA ベースのソフトウェア ツールです。生成、各種データ注釈足場ツリー階層内でのナビゲーションを使用できます。
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JOELib/JOELib2は、SMARTS構造式での検索、ディスクリプタ計算、パイプのフィルタリング/加工、ファイル形式の変換、外部プログラム(例えばGhemical)のインターフェースなどをサポートした化学情報管理(cheminformatics)ライブラリです。
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GaussSumは、有益な情報(構造最適化の進行状況、UV/IR/ラマンスペクトル、MO係数、他)を抽出するためにADF、GAMESS、GAMESS-US、Gaussianの出力を解析します。
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